1998年7月原华西医科大学在获得美国纽约中华医学基金会（CMB）资助下，经卫生部批准成立由陈敏章部长，彭玉、曹荣桂副部长，科技、医政、计财和国际交流司司长，华西医学中心张肇达校长和附一院李幼平教授组成的协调领导小组，并由原科技司成果处于修成处长任秘书，具体规划循证医学在中国的建立。

　　1999年3月国际Cochrane协作网正式批准中国中心注册成为世界上第13个中心，也是亚洲第1个、亚太地区第2个Cochrane中心。中心主任李幼平教授于己于1999年初月被选为国际Cochrane协作网14人指导委员会成员之一，成为该委员会中唯一的亚洲代表，并代表发展中国家参与协作网的高层决策。

　　作为国际Cochrane协作网的成员之一和中国与国际协作网的唯一接口，中国循证医学中心起到了倡导并促进循证的医疗保健、转变医疗模式的作用，包括：循证决策、循证病房、循证护理、循证医疗管理、循证医学教育和继续教育、循证科研选题、循证上市药物评价、循证卫生管理等方面的内容。它的主要任务是：1、宣传、普及：编译出版循证医学的教材、专著、普及读物，宣传循证医学思想，倡导并全面推广循证医学（中医、西医），促进有限卫生资源的高效使用。2培训：培训循证医学师资及骨干人才。3、研究：建立中文临床试验数据库与国际进行双向交流；参与相关专题的Cochrane Review Groups(CRG)生产系统评价；组织开展高质量的临床研究等。